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技術支持

致力于引進國外先進技術,為廣大科研工作者和醫療機構提供高質量 的科研技術支持 。

高通量測序樣品

樣品制備指南

動植物基因組de novo 測序

 

樣品總量:小片段文庫樣本制備需要總量大于1 μg 的樣品,mate-pair 文庫(2 kb、5 kb、10 kb、)樣品,制備需要總量20-50 μg ,

為保證實驗質量及延續性,請一次性提供至少2 次樣本制備總量;

樣品濃度純度:樣品濃度>200 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無蛋白質、RNA 或者肉眼可見雜質污染;

樣品質量:基因組完整、無降解,電泳結果基因組DNA 主帶應在入-Hind llldigest 最大條帶23 KB 以上且主帶清晰,無彌散;

樣品保存:請保存于干粉、酒精、TE buffer 或超純水中,并請在樣品信息單中注明。

 

動植物基因組重測序

 

DNA 樣品總量:每次建庫需要準備樣品1 μg,建議單次送樣提供2 次制備總量;

樣品濃度和純度:樣品濃度>50 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無肉眼可見雜質污染,基因組完整、無降解,電泳中DNA 主帶

應大于23 kb;

樣品選擇:對于植物樣品建議選取黑暗培養的黃化苗或嫩苗,動物樣品應選擇肌肉、血等脂肪含量較少的組織進行取樣;

樣品保存:請選擇干粉、酒精、TE 或超純水的保存方式。

 

全外顯子組及目標區域重測序

 

DNA 樣品總量:請一次性提供至少1 μg 高質量的基因組DNA;

樣品濃度和純度:樣品濃度>50 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無肉眼可見污染;

樣品質量:基因組完整、無降解,電泳中DNA 主帶應大于23 kb;

樣品選擇:對于植物樣品建議選取黑暗培養的黃化苗或嫩苗,動物樣品應選擇肌肉、血等脂肪含量較少的組織進行取樣;

樣品保存:請選擇干粉、酒精、TE 或超純水中進行保存。

 

微生物基因組de novo 測序

 

DNA 樣品總量:小片段文庫樣品制備需要總量3 μg 的樣品,mate-pair 文庫(2 kb、5 kb、10 kb)樣品制備需要10-50 μg 的樣

品, 為保證實驗質量及延續性,請一次性提供至少2 次樣品制備量;

樣品濃度和純度:樣品濃度>100 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無肉眼可見污染;

樣品質量:基因組完整、無降解;

樣品選擇:對于細菌和真菌樣品,希望盡量來自于同一個菌株,不要有宿主DNA 污染;

樣品保存:請選擇干粉、酒精、TE 或超純水的保存方式之一。

 

轉錄組測序


轉錄組樣品:RNA 樣品總量: ≥ 1.0 μg,RNA 樣品濃度: ≥ 50 ng/μl;

樣品濃度和純度:樣品濃度>100 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無肉眼可見污染;

樣品質量:使用Agilent Bioanalyzer 儀器檢測,則獲得的總的RNA 28S:18S >1,RIN 動物>7,RIN 植物 >6.5;

樣品選擇:對于細菌和真菌樣品,希望盡量來自于同一個菌株,不要有宿主DNA 污染;

樣品保存:請選擇乙醇、DEPC 水保存樣品,并在樣品信息單中注明;

樣品運輸:樣品請置于1.5 ml 管中,并使用封口膜封好后干冰運輸, 請勿反復凍融。


小RNA 測序


RNA 樣品總量:一次性提供至少3 μg 高質量的總RNA;

樣品濃度和純度:樣品濃度>100 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無肉眼可見污染;

樣品質量:使用Agilent Bioanalyzer 儀器檢測,則獲得的總的RNA 28S:18S >1,RNA>7.5;

樣品保存:請選擇乙醇、DEPC 水保存樣品,并在樣品信息單中注明;

樣品運輸:樣品請置于1.5 ml 管中,并使用封口膜封好,放置足夠的干冰運輸。

 

lncRNA 測序

 

轉錄組樣品:RNA 樣品總量 ≥ 2.0 μg,RNA 樣品濃度 ≥ 100 ng/μl;

樣品濃度和純度:樣品濃度>100 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無肉眼可見污染;

樣品質量:使用Agilent Bioanalyzer 儀器檢測,則獲得的總的RNA 28S:18S>1,RIN 值 >7.5;

樣品選擇:對于細菌和真菌樣品,希望盡量來自于同一個菌株,不要有宿主DNA 污染;

樣品保存:請選擇乙醇、DEPC 水保存樣品,并在樣品信息單中注明;

樣品運輸:樣品請置于1.5 ml 管中,并使用封口膜封好后干冰運輸,請勿反復凍融。

 

表觀遺傳學相關DNA 測序

 

DNA 樣品總量:全基因甲基化測序需提供3 μg 的基因組DNA,RRBS 需提供至少4 μg 的DNA,ChIP-seq 和MeIDP-seq 需提供

至少30 ng 的抗體富集后的DNA 片段樣品(片段長度200-500 bp),為保證質量和延續性,請一次性提供至少2 次樣本制備量;

樣品濃度和純度:基因組DNA 樣品濃度>100 ng/μl,富集后DNA 樣品濃度>5 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無肉眼可見污染;

樣品保存:請選擇乙醇、純水進行保存,并在樣品信息單中注明;

樣品運輸:請將樣品置于1.5 ml 管中,并用封口膜封好。

 

宏基因組測序

 

樣品總量:環境細菌多樣性分類一次文庫制備所需要的樣品量為1 μg DNA,宏基因組測序一次文庫制備所需要的樣品量為3 μg DNA,

為保證實驗的質量及延續性,請一次性提供至少兩次的制備量(注:不同環境DNA 質量差別較大,具體樣品量請咨詢當地技術人員);

樣品濃度和純度:環境樣品濃度>50 ng/μl,宏基因組為30 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無蛋白質、RNA 或肉眼可見雜質污染;

樣品質量:基因組完整、無降解,電泳結果基因組DNA 主帶在預期位置,清晰,無彌散,cDNA 片段化樣品,片段大小符合預期位置;

樣品保存:請選擇干粉、酒精、TE buffer 或超純水一種,并在樣品信息單中注明;

樣品運輸:請將樣品置于1.5 ml 管中,做好標記,并用封口膜好,并同《測序樣品訂單》一起放在塑料樣品袋封口,基因組DNA 如果

用乙醇沉淀,可以常溫運輸。

 

雙酶切RAD 測序

 

客戶提供:目的物種的基因組信息或近源參考基因組的信息,限制性內切酶的種類信息;

樣品總量:每個樣品制備需要大于3 μg 的樣品,為保證實驗質量及延續性,請一次性提供至少4 μg 的樣品;

樣品濃度和純度:樣品濃度>50 ng/μl,OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無蛋白質、RNA 或肉眼可見雜質污染;

樣品質量:基因組完整、無降解,電泳結果基因組DNA 主帶應在-Hind III digest 最大條帶23 kb 以上且主帶清晰,無彌散;

樣品保存:請選擇干粉、酒精、TE buffer 或超純水一種,并在樣品信息單中注明。

 

細胞器基因組de novo 測序

 

樣品總量:使用密度梯度離心分離后的樣品一次制備DNA 文庫的量至少為0.5 μg DNA,PCR 富集方法樣品一次制備需要至少

200 ng DNA,建議客戶提供兩次計品的總量;

樣品濃度和純度:OD260/280 介于1.8-2.0 之間,無蛋白質、RNA 或肉眼可見雜質污染;

樣品質量:基因組完整、無降解,電泳結果基因組DNA 主帶清晰,無彌散;

樣品保存:請選擇干粉、酒精、TE buffer 或超純水一種,并在樣品信息單中注明。

 

擴增子測序

 

常見環境樣本(請使用干冰或冰袋運送):土壤、淤泥、沉積物 ≥ 3 g,糞便 ≥ 500 mg,組織樣本 ≥ 1g;

水體送樣為過濾后的濾膜( 最適濾膜直徑3-4 cm,孔徑大小一般選擇0.22 μm 或者0.45 μm);

拭子樣本 ≥ 2 個;

DNA/PCR 產物(請使用干冰或冰袋運送);

DNA:濃度 ≥ 5 ng/μl,總量 ≥ 150 ng,DNA 要有明顯主帶,無降解,無RNA、蛋白質等雜質污染;

PCR 產物:濃度 ≥ 20 ng/μl,總量 ≥ 400 ng,片段大?。?450 bp,條帶單一,無降解,無引物二聚體。



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