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細菌 16S 區序列分析

細菌 16S 區序列分析


服務介紹  Service Introduction


          細菌的 rRNA 是細胞內含量最多的 RNA,約占 RNA 總量的 80% 以上,由高度保守區和可變區組成。

        細菌的 rRNA 包括 5S、 16S、 23S,其中 5S rRNA 信息量少,不適合分析。23S rRNA 盡管分子大,信息量多,但堿基突變速度較快,同樣不適用于細菌鑒定。16S rDNA 是編碼原核生物核糖體小亞基 16S rRNA的 DNA 序列,相比之下遺傳較為穩定,長度在 1550±200 bp 左右,信息量適中,可以用于研究系統進化。目前已經報道了 10,000 種以上的細菌 16S rDNA 序列。


技術流程 Technical Procedures


技術流程圖

流程圖2.png


流程圖3.png

16s rDNA 示意圖 

樣品要求及注意事項 Sample Requirements And Notes 


   kyfwtx.png 基因組 DNA:OD 260/280 在 1.8-2.0 之間(OD260/230 最好大于 1.5),濃度 ≥ 30 ng/μl, 體積 ≥ 20 μl,且無明顯降解; 

  kyfwtx.png 建議提供培養過的菌液,體積 >2 ml,請確保提供的菌液是經過分離培養的單菌落,因樣本不純造成的測序雙峰,將全額收取實驗費用;

  kyfwtx.png 特殊樣品 , 如放線菌、厭氧菌等,請直接提供基因組 DNA,革蘭氏陽性菌,建議提供基因組 DNA;

  kyfwtx.png 不接受有致病性的樣品 , 如果菌體帶有致病性,請提供基因組 DNA,并進行加熱處理以殺死致病菌;

  kyfwtx.png 由于有些真菌形態與細菌相似,難以判斷,在無法獲得 16S rDNA 結果時,建議考慮進行真菌 ITS 區序列分析; 

  kyfwtx.png 對于測序雙峰的樣本,可以提供克隆測序的服務。


交付結果  Results Delivery


  kyfwtx.png 測序峰圖及序列文件 

  kyfwtx.png 16S rDNA 序列拼接文件 

  kyfwtx.png 序列分析比對結果


服務價格 Pricing Information


價格2.png

* 對于測序雙峰的樣品,可提供克隆測序服務,價格:300 元 / 樣品; 包含:片段克隆,4 個陽性克隆測序,序列比對分析。


IGE-細菌菌種鑒定委托書.doc




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